В течение внутриутробной жизни у плода закладывается кишечная трубка, которая дает начало всему желудочно-кишечному тракту. В процессе своего развития, удлинившаяся кишечная трубка совершает ряд поворотов, обеспечивающих расположение петель тонкого кишечника и толстой кишки, характерное для здорового новорожденного. При воздействии самых разнообразных неблагоприятных факторов во время беременности развитие и повороты кишечной трубки могут нарушаться, что приводит к врожденным порокам, прежде всего, к врожденной кишечной непроходимости. При нарушении процессов развития кишечной трубки и формирования ее просвета возникают стенозы (сужения), обтурации (полное закрытие просвета) и атрезии (недоразвитие) кишечной трубки.
Кроме того, причиной врожденной кишечной непроходимости могут быть пороки развития других органов брюшной полости (поджелудочной железы, нервных узлов и др.).
Для кишечной непроходимости характерна рвота, в ряде случаев видимая усиленная перистальтика (сокращение) кишечника, вздутие живота, отсутствие стула, в дальнейшем — нарушение общего состояния ребенка (обезвоживание, сгущение крови, потеря массы тела и др.).
С помощью операции (иногда не одной) хирурги восстанавливают проходимость желудочно-кишечного тракта и, при отсутствии других пороков развития, прогноз при врожденной кишечной непроходимости хороший.